Superset
Superset aide à connecter MEDomics à des serveurs et bases de données distants (disponible à partir de la v1.7.0).
Apache Superset est un logiciel open-source application conçue pour l'exploration et la visualisation de données. Il offre une large gamme de fonctionnalités telles que la création de tableaux de bord, des outils de graphiques divers et l'intégration avec diverses sources de données.
Superset est désormais intégré à MEDomics, offrant aux utilisateurs un accès direct à ses puissantes fonctionnalités d'un simple clic, éliminant la nécessité d'un environnement de travail externe (par ex. ). Cette intégration permet aux utilisateurs de lancer et d'utiliser Superset directement dans MEDomics, leur permettant de visualiser des données, concevoir des tableaux de bord, exporter des graphiques, et plus encore—le tout au sein d'une plateforme unifiée.
Sur cette page, nous fournirons un guide complet sur la façon d'utiliser Superset dans MEDomics.
Le panneau Superset
Lorsque vous lancez MEDomics, vous remarquerez un panneau Superset situé en bas à gauche de l'interface, comme montré dans la figure ci‑dessous. Ce panneau propose deux options principales : Lancer Superset et Visionneuse de tableau de bord.

"Lancer Superset" Bouton
Cliquer sur le Lancer Superset bouton démarre Superset en arrière-plan et l'intègre dans l'application MEDomics. Cette fonctionnalité gère tous les changements de configuration et les étapes d'initialisation nécessaires, comme la création d'un nouvel utilisateur admin. En cliquant sur le bouton, une barre de progression apparaîtra, indiquant l'état de chaque étape du processus de lancement.

Une fois Superset entièrement lancé, vous serez dirigé vers la page de connexion de Superset. Utilisez les identifiants par défaut suivants pour vous connecter :
Nom d'utilisateur :
adminMot de passe :
admin

Après vous être connecté, vous pouvez commencer à explorer les puissants outils de visualisation de données et de création de tableaux de bord de Superset directement dans MEDomics🎉.

Outils Superset
MEDomics propose des outils intégrés pour simplifier la gestion de la plateforme sans vous obliger à quitter l'environnement MEDomics. Ces outils comprennent :
Rafraîchir la page pour recharger les données ou mettre à jour les tableaux de bord.
Créer de nouveaux utilisateurs pour un accès collaboratif.
Modifier le fichier de configuration de Superset pour activer des fonctionnalités supplémentaires de la plateforme.
Arrêter le serveur Superset une fois votre travail terminé pour une gestion efficace des ressources.

"Visionneuse de tableau de bord" Bouton
Le Visionneuse de tableau de bord bouton ouvre un intégrateur de tableau de bord, vous permettant de visualiser des tableaux de bord partagés en utilisant leur ID de tableau de bord. Cette fonctionnalité garantit un accès sécurisé à des tableaux de bord spécifiques tout en protégeant les données sensibles contre les accès non autorisés.
Avant d'utiliser la Visionneuse de tableau de bord, vous aurez besoin d'un ID de tableau de bord. Suivez ces étapes pour le récupérer :
Ouvrez un tableau de bord (par ex., les données de la Banque mondiale).
Cliquez sur les trois points (
...) à côté de MODIFIER LE TABLEAU DE BORD.Sélectionnez Intégrer le tableau de bord.
Copiez l'ID de tableau de bord fourni.
Ajoutez l'adresse suivante aux Domaines autorisés dans les paramètres de Superset :
http://localhost:8888.
Ces étapes sont illustrées dans la figure ci‑dessous.

Une fois que vous avez cliqué sur le Visionneuse de tableau de bord bouton, une interface vous invitera à entrer l'ID du tableau de bord et le port du serveur Superset. Puisque tout s'exécute localement, Superset doit également être en cours d'exécution localement pour accéder au tableau de bord. MEDomics affiche commodément le port de toute instance Superset active en arrière-plan.

Après avoir saisi les informations requises, cliquez sur Connexion pour commencer à visualiser votre tableau de bord. Bonne visualisation de vos tableaux de bord 👏.

Exporter des données vers votre espace de travail
Superset permet aux utilisateurs d'exporter des données directement depuis la plateforme vers leur stockage local. Cette fonctionnalité vous permet de transférer vos données vers l'espace de travail de MEDomics, où elles peuvent être utilisées dans divers autres outils (par ex. outils d'entrée par exemple) pour une analyse ou un traitement ultérieur. Voici les étapes pour exporter vos données vers l'espace de travail :
Exécuter une requête SQL : Commencez par exécuter une requête SQL simple, telle que
SELECT * FROM YOUR_DATASET, pour récupérer les données que vous souhaitez exporter.Télécharger en CSV : Une fois les résultats de la requête affichés, cliquez sur le bouton TÉLÉCHARGER EN CSV .
Enregistrer dans l'espace de travail : Sélectionnez votre espace de travail MEDomics comme destination et enregistrez le fichier.
Ces étapes sont illustrées dans la figure ci‑dessous.

Cette fonctionnalité garantit que vos données sont facilement disponibles pour une utilisation dans différents outils au sein de MEDomics.
Ressources utiles
Mis à jour